EMBER_CLI_FASTBOOT_BODY

Секвенирование 3-го поколения на Oxford Nanopore

The course meets the formal recommendations of Stepik
Video Player is loading.
Current Time 0:00
/
Duration 0:00
Loaded: 0%
Progress: 0%
Stream Type LIVE
Remaining Time -0:00
 
1x
Play
To watch this video please visit https://stepik.org/lesson//step/

About the course

Секвенирование 3-го поколения (3rd generation NGS) - методы высокоэффективного секвенирования, позволяющие получать длинные прочтения (от 1 тыс. и до миллионов нуклеотидов). Наш курс посвящен секвенированию при помощи приборов от компании Oxford Nanopore. Вы познакомитесь с теоретическими основами работы этих приборов, получите практические советы по запуску и решению основных проблем в работе, а также ознакомитесь с особенностями биоинформатической обработки длинных прочтений.

Данный курс требует понимания основ молекулярной биологии, секвенирования, и биоинформатики, однако не имеет жестких требований по предварительному прохождению других курсов.

Instructors

  1. User picture
    Alexander Predeus
    PhD in chemistry doing genomic bioinformatics
    Я интересуюсь всем, связанным с современными методами секвенирования (next-generation sequencing) - биологическими задачами, экспериментальными методами, и биоинформатическим анализом, который позволяет получать максимальное количество информации из геномных и транскриптомных экспериментов. Имею большой опыт анализа экзомов, RNA-seq, и ChIP-seq. Также интересуюсь молекулярной динамикой и структурной биоинформатикой. Закончил химический факультет МГУ в 2003-м году. В 2009-м году получил степень Ph.D. в Michigan State University, после чего работал в Michigan State University и Washington University in St. Louis (School of Medicine). С лета 2015-го года стал директором по науке в Институте биоинформатики в Санкт-Петербурге. https://www.researchgate.net/profile/Alexander_Predeus
  2. User picture
    Alexandra Beliavskaia
    аспирант-биолог
    Я биолог по призванию и образованию, интересуюсь симбиотическими отношениями во всех проявлениях, в частности генетической составляющей. Закончила биологический факультет СПбГУ, сейчас учусь в аспирантурах СПбГУ и Ливерпульского университета, где изучаю симбиотических бактерий и простейших и осваиваю методы секвенирования с единичных клеток. https://www.researchgate.net/profile/Alexandra_Beliavskaia

Reviews

5
Курс интересный, много новых знаний получил.
5
Спасибо! Отличный курс, который помогает составить общее представление о новой технологии.
Владимир December 24, 2018 link
5
Изучал с удовольствием. Узнал много нового. Благодаря созданию этого курса Вы смело можете считать себя основоположниками грядущей геномной революции в России. Большое спасибо! Владимир Зубов (genseq)
Play
To watch this video please visit https://stepik.org/lesson//step/
4.9 All reviews

Основы секвенирования 3-го поколения на платформе Oxford Nanopore. Рассматриваются основные применения, типы предлагаемых приборов, используемые протоколы, и особенности биоинформатической обработки получаемых данных.

Open date:
Nov 15, 2018
Workload:
2 часа в неделю
Expected time to complete:
5 hours
Language:
Русский
Certificate:
по успешному окончанию курса выдается сертификат
Certificate details
Certificate condition: 40 points
With distinction: 45 points

About the course

Секвенирование 3-го поколения (3rd generation NGS) - методы высокоэффективного секвенирования, позволяющие получать длинные прочтения (от 1 тыс. и до миллионов нуклеотидов). Наш курс посвящен секвенированию при помощи приборов от компании Oxford Nanopore. Вы познакомитесь с теоретическими основами работы этих приборов, получите практические советы по запуску и решению основных проблем в работе, а также ознакомитесь с особенностями биоинформатической обработки длинных прочтений.

Данный курс требует понимания основ молекулярной биологии, секвенирования, и биоинформатики, однако не имеет жестких требований по предварительному прохождению других курсов.

Requirements

Данный курс требует понимания основ молекулярной биологии, секвенирования, и биоинформатики, однако не имеет жестких требований по предварительному прохождению других курсов.

Target audience

Исследователи, использующие высокоэффективное секвенирование (NGS) в повседневной работе — как молекулярные биологи, так и биоинформатики.

This course is entirely free. All content is available now.