Чему вы научитесь
- понимать принципы работы современных информационных технологий применительно к наукам о жизни;
- использовать методы сбора, обработки, систематизации полевой и лабораторной информации, применять технологии информатики биоразнообразия;
- владеть навыками профессионального оформления результатов научных разработок, управлять процессами внедрения их в реальную деятельность.
О курсе
Цель освоения курса – получение практических навыков использования современных компьютерных технологий и информационных достижений, применительно к обработке, передаче и хранению биологических данных.
Данный курс полезен для биологов, а также прочим исследователям, которые прямо или косвенно занимаются живыми объектами (экологи, географы, палеонтологи, прикладные математики, натуралисты). Если вы стремитесь повысить методологический уровень ваших курсовых и дипломных работ, а также обогатить проектную деятельность в школе, то этот курс для вас. Полученные навыки по итогу курса могут быть использованы для подготовки научного проекта, дипломной работы, диссертационного исследования и научной статьи.
Проект реализуется победителем грантового конкурса для преподавателей магистратуры 2023/2024 Стипендиальной программы Владимира Потанина.
В 2024 году в рамках проекта "Компьютерные технологии в биологии" проходит национальный конкурс, подробности в видео по ссылке.
Благодаря внедрению в курс технологий «360VR» обучающимся доступны виртуальные экскурсии и видеоруководства полного присутствия в полевой, камеральной и лабораторной обстановке в разделе «VR-360VIDEOХАБ».
Погрузитесь в мир виртуальной реальности нереального Алтая посетив Интерактивную карту – «Виртуальные экскурсии по Алтаю – 360VR-АЛТАЙ». «Испытательным полигоном» для апробации и внедрения практических инструментов онлайн курса выступает биоразнообразие Алтайской горной страны.
Стратегическим партнером курса является Глобальная информационная система по биоразнообразию (GBIF, соглашение с АлтГУ).
Ключевыми партнерами проекта являются: Музей естественной истории в Университете Осло (Natural History Museum at the University of Oslo) (Норвегия, Осло); Министерство природных ресурсов и экологии Алтайского края (Алтайский край); Казахский национальный университет имени аль-Фараби (Республика Казахстан); Алтайский государственный природный биосферный заповедник (Республика Алтай); Катон-Карагайский национальный парк (Республика Казахстан); Институт ботаники и фитоинтродукции (Республика Казахстан) и Тигирекский государственный заповедник (Алтайский край).
Дополнительная связь с преподавателем – @vaganov_vav
Сообщество курса ВК: http://vk.com/kompbio
Портфолио автора: https://sites.google.com/site/vaganovalexeyv/home
Для кого этот курс
В первую очередь биологи (наиболее полезно ботаникам, зоологам, микологам – все те, кто занимается таксономией всех живых организмов на планете Земля), экологи и географы, а также интересно может быть математикам (обработка больших данных, моделирование), педагогам (наглядный материал для цифровых средств обучения), палеонтологам, любителям природы и юным натуралистам.
Начальные требования
Персональный компьютер, смартфон, сеть Интернет, набор бесплатных специализированных пакетов для профессиональной работы по курсу (ссылки для скачивания приведены в уроках курса).
Наши преподаватели
Как проходит обучение
Фундаментом курса является биосферно-организменный и молекулярно-генетический уровни организации живого на планете Земля. Онлайн курс содержит видеоруководства, практические задания, видеолекции, тренинги и тесты.
При работе с биологическими данными в курсе рассмотрены практические инструменты:
- хранения и обработки биоданных;
- мобилизации и нормализации биоданных;
- анализа последовательностей ДНК и хранения в генбанках;
- геоинформационных систем (ГИС) и географического зонирования;
- филогении и реконструкции таксономических связей, эволюционного анализа;
- оцифровки биологических коллекций и ведения цифровых депозитариев;
- моделирования прогнозных местообитаний живых объектов;
- практики подготовки презентационных материалов.
По окончанию курса вы получите специальные практические навыки работы с бесплатными пакетами программ (Open Refine, DIVA-GIS, Mesquit, MEGA, MaxEnt), открытыми глобальными ресурсами и спецификациями (GBIF, Darwin Core, iNaturalist, BOLD GenBank (NCBI, EMBL-EBI), GeoJSON), специализированными ресурсами и базами знаний (электронные библиотеки, базы цитирования и пр.) для эффективной работы ученого-биолога.
Программа курса
