Компьютерные технологии в биологии

21 век отмечен масштабным развитием цифровизации и стремительной эволюцией IT-решений. На наше поколение пришелся расцвет области знаний "Науки о жизни". Именно сейчас важно обеспечить себя инструментарием современных компьютерных технологий и эффективно инсталлировать в свой научный процесс потенциал сети Интернет.
два часа в неделю
Stepik certificate

About this course

Цель освоения курса – получение практических навыков использования современных компьютерных технологий и информационных достижений, применительно к обработке, передаче и хранению биологических данных.

Данный курс полезен для биологов, а также прочим исследователям, которые прямо или косвенно занимаются живыми объектами (экологи, географы, палеонтологи, прикладные математики, натуралисты). Если вы стремитесь повысить методологический уровень ваших курсовых и дипломных работ, а также обогатить проектную деятельность в школе, то этот курс для вас. Полученные навыки по итогу курса могут быть использованы для подготовки научного проекта, дипломной работы, диссертационного исследования и научной статьи.

 

Автор онлайн курса – Ваганов Алексей Владимирович – победитель грантового конкурса Стипендиальной Программы Владимира Потанина 2019–2020 и 2021–2022 уч. гг.

Онлайн курс подготовлен с использованием гранта Благотворительного фонда Владимира Потанина.

 

Фундаментом курса является биосферно-организменный и молекулярно-генетический уровни организации живого на планете Земля.

При работе с биологическими данными о живых организмах в курсе рассмотрены практические инструменты из сферы:

  • информатики биоразнообразия (стандарты и протоколы хранения и обработки объективных данных о пространственном распространении живых организмов);
  • анализа ДНК и молекулярно-генетических баз данных живых организмов (Генбанк);
  • геоинформационных систем (ГИС) и географического зонирования;
  • филогении и реконструкции таксономических связей живых организмов (филогенетическое дерево);
  • модульного эволюционного анализа;
  • подходы к ведению цифровых депозитариев и оцифровки биологических коллекций;
  • моделирование прогнозного местообитания живого объекта (построение экологических ниш);
  • подготовка презентационных научных материалов.

По окончанию курса вы получите специальные практические навыки работы с бесплатными пакетами программ (DIVA-GIS, Mesquit, MEGA, MaxEnt), открытыми глобальными ресурсами и спецификациями (GBIF, Darwin Core, iNaturalist, GenBank (NCBI, EMBL-EBI), GeoJSON), специализированными ресурсами и базами знаний (электронные библиотеки, базы цитирования и пр.) для эффективной работы ученого-биолога, занятого исследованием живых объектов на планете Земля.

Онлайн курс подготовлен в Алтайском государственном университете.

Стратегическим партнером курса является Глобальная информационная сеть по биоразнообразию (GBIF, соглашение с АлтГУ). 

Ключевыми партнерами проекта являются: Музей естественной истории в Университете Осло (Natural History Museum at the University of Oslo) (Норвегия, Осло); Министерство природных ресурсов и экологии Алтайского края (Алтайский край); Казахский национальный университет имени аль-Фараби (Республика Казахстан), Катон-Карагайский национальный парк (Республика Казахстан); Институт ботаники и фитоинтродукции (Республика Казахстан) и Тигирекский государственный заповедник (Алтайский край).

Дополнительная связь с преподавателем – @vaganov_vav

Сообщество курса ВК: http://vk.com/kompbio

Портфолио автора: https://sites.google.com/site/vaganovalexeyv/home

Whom this course is for

В первую очередь биологи (наиболее полезно ботаникам, зоологам, микологам – все те, кто занимается таксономией всех живых организмов на планете Земля), экологи и географы, а также интересно может быть математикам (обработка больших данных, моделирование), педагогам (наглядный материал для цифровых средств обучения), палеонтологам, любителям природы и юным натуралистам.

Initial requirements

Персональный компьютер, смартфон, сеть Интернет, набор бесплатных специализированных пакетов для профессиональной работы по курсу (ссылки для скачивания приведены в уроках курса).

Meet the Instructors

Course content

loading...
Certificate

Certificate

Stepik certificate
Price: Free

Share this course

Price: Free